Od dnia 1 września 2017 roku obowiązki dyrektora Instytutu Inżynierii Środowiska pełni dr hab. inż. Mirosław Wiatkowski, prof. nadzw. Zastąpił na tym stanowisku prof. dr. hab. inż. Stanisława Czabana, który sprawował tę funkcję nieprzerwanie od 1990 roku.